DSpace Arşivi :: Ana Sayfa

İZÜ Araştırma ve Akademik Performans Sistemi

DSpace@İZÜ, İstanbul Sabahattin Zaim Üniversitesi’nin bilimsel araştırma ve akademik performansını izleme, analiz etme ve raporlama süreçlerini tek çatı altında buluşturan bütünleşik bilgi sistemidir.

Koleksiyonlar

Araştırmacılar

Projeler

Birimler

WoS Yayınları

Scopus Yayınları

TR-Dizin Yayınları

PubMed Yayınları

Makaleler

Kitaplar

Bildiriler

Tezler

Güncel Gönderiler

Optimal Res-UNET Architecture with Deep Supervision for Tumor Segmentation
(Frontiers Media SA, 2025) Maqsood, Rahman; Abid, Fazeel; Rasheed, Jawad; Osman, Onur; Alsubai, Shtwai; Rasheed, Jawad;
Background: Brain tumor segmentation is critical in medical imaging due to its significance in accurate diagnosis and treatment planning. Deep learning (DL) methods, particularly the U-Net architecture, have demonstrated considerable promise. However, optimizing U-Net variants to enhance performance and computational efficiency remains challenging.Objective: To develop an optimized Residual U-Net (Res-UNET) architecture enhanced by deep supervision techniques to improve segmentation accuracy of brain tumors on MRI datasets, specifically addressing challenges of conventional segmentation methods.Methods: The study implemented a detailed evaluation of multiple U-Net variations, including basic U-Net, Res-UNet with Autoencoder regularization, and attention-enhanced U-Net architectures. Training was conducted using the BraTS 2018 public MRI dataset. Deep supervision was integrated to improve gradient propagation and segmentation accuracy. The model employed a Dice loss combined with focal loss to handle data imbalance effectively. The proposed network was evaluated using extensive ablation studies, examining the effects of encoder complexity, convolutional filter count, and strategic post-processing.Results: The proposed Res-UNET with deep supervision outperformed other variants, achieving an average Dice score of 0.9498 through five-fold cross-validation. Post-processing strategies improved the robustness of segmentation, particularly enhancing the accuracy of small tumor regions. Comparatively, conventional U-Net architectures yielded lower Dice scores and required significantly longer training times. The study indicates the benefit of integrating deep supervision and residual connections for enhanced model performance.Conclusion: Optimized Res-UNET with deep supervision significantly enhances segmentation accuracy for brain tumors in MRI images, surpassing traditional U-Net models. This model addresses critical issues such as dataset imbalance, lack of annotated data, and computational inefficiencies. Future studies should consider the broader application of optimized U-Net variants across other medical imaging segmentation tasks.
Lightweight CNN for Accurate Brain Tumor Detection from MRI with Limited Training Data
(Frontiers Media SA, 2025) Bin Naeem, Awad; Osman, Onur; Alsubai, Shtwai; Çevik, Taner; Zaidi, Abdelhamid; Rasheed, Jawad; Rasheed, Jawad;
Aim: This study aims to develop a robust and lightweight deep learning model for early brain tumor detection using magnetic resonance imaging (MRI), particularly under constraints of limited data availability. Objective: To design a CNN-based diagnostic model that accurately classifies MRI brain scans into tumor-positive and tumor-negative categories with high clinical relevance, despite a small dataset. Methods: A five-layer CNN architecture—comprising three convolutional layers, two pooling layers, and a fully connected dense layer—was implemented using TensorFlow and TFlearn. A dataset of 189 grayscale brain MRI images was used, with balanced classes. The model was trained over 10 epochs and 202 iterations using the Adam optimizer. Evaluation metrics included accuracy, precision, recall, F1 Score, and ROC AUC.Results: The proposed model achieved 99% accuracy in both training and validation. Key performance metrics, including precision (98.75%), recall (99.20%), F1-score (98.87%), and ROC-AUC (0.99), affirmed the model’s reliability. The loss decreased from 0.412 to near zero. A comparative analysis with a baseline TensorFlow model trained on 1,800 images showed the superior performance of the proposed model.Conclusion: The results demonstrate that accurate brain tumor detection can be achieved with limited data using a carefully optimized CNN. Future work will expand datasets and integrate explainable AI for enhanced clinical integration.
YAP-Mediated DDX3X Confers Resistance to Ferroptosis in Breast Cancer Cells by Reducing Lipid Peroxidation
(Elsevier Ltd., 2025) Dai, Jia-Zih; Hsu, Wen-Jing; Lin, Mei-Hsiang; Pei-Wei Sheung; Lee, Chi-Ching; Yang, Ching-Chieh; Lin, Cheng-Wei; Lee, Chı-Chıng
Metabolic shifts in cancer cells were found to participate in tumorigenesis, especially driving chemotherapeutic resistance. Ferroptosis is a newly discovered form of cell death induced by excessive accumulations of iron and lipid peroxidation. Susceptibility to ferroptosis can be intrinsically regulated by various cellular metabolic pathways. Therefore, inducing ferroptosis might be a promising anticancer therapeutic strategy. DEAD-box helicase 3 X-linked (DDX3X), a critical modulator of RNA metabolism, was identified as an oncogene in breast cancer and also participates in cancer metabolism and chemotherapeutic resistance. However, the molecular regulation of the association between DDX3X and ferroptosis is largely unknown. Herein, we investigated the correlation between resistance to ferroptosis and DDX3X expression in breast cancer cells. We found that elevation of DDX3X was associated with increased resistance to a ferroptosis inducer in breast cancer cells, and manipulating DDX3X expression regulated the sensitivity to the ferroptosis inducer. Importantly, DDX3X upre-gulated expression of the anti-ferroptotic enzyme glutathione peroxidase 4 (GPX4) gene to confer ferroptosis resistance in breast cancer cells. Moreover, DDX3X was transcriptionally upregulated by the yes-associated protein (YAP). Knockdown of YAP downregulated DDX3X mRNA expression and facilitated lipid peroxidation, but that were restored in the presence of DDX3X. Clinically, coexpression of DDX3X and YAP was found in a variety of malignancy, and their elevation conferred poor survival prognosis in patients with breast cancer. Together, our findings reveal the crucial role of DDX3X in sensitivity to ferroptosis and underscore its potential as a diagnostic marker and therapeutic target. DDX3X renders resistance to ferroptosis and plays a role in mitigating lipid peroxidation, paving the way for therapeutic vulnerability via targeting cancer metabolism.
تقييم فاعلية أدوات التسويق الإلكتروني في تحفيز الأفراد للتبرع للجمعيات الخيرية
(İstanbul Sabahattin Zaim Üniversitesi, 2024) Ahmad Tawfik, Erfan; Mahaini, Mohammad Ghaıth
Bu çalışma, elektronik pazarlama araçlarının bireyleri hayır kurumlarına bağış yapmaya teşvik etmedeki etkinliğini değerlendirmeyi amaçlamaktadır. Çalışma, elektronik pazarlama etkinliğini ölçmenin en önemli yöntemlerini ve hayır kurumları tarafından kullanılan elektronik pazarlama araçlarını incelemekte olup, ayrıca hayır kurumlarına gelen bağışlardan pazarlama giderlerinin kesilmesi konusundaki görüşler ve fıkıh kurallarını ele almaktadır. Çalışmanın amaçlarına ulaşmak için anket bir araştırma aracı olarak kullanılmış ve veriler, Yapısal Eşitlik Modellemesi (Structural Equation Modeling) tekniği kullanılarak istatistiksel olarak incelenmiş ve analiz edilmiştir. AOMS programı kullanılarak yapılan analizler sonucunda, elektronik pazarlama araçlarının bireyleri bağış yapmaya teşvik etmede etkili bir rol oynadığı ve bireylerin güveni ve memnuniyetinin bu bağlamda ana faktörler olduğu ortaya çıkmıştır. Çalışma, sosyal medya araçları ve çevrimiçi reklamlar ile bağış yapma teşviki arasında istatistiksel olarak anlamlı doğrudan pozitif bir ilişki ve etkisi olduğunu, içerik platformları ile bağış yapma teşviki arasında ise istatistiksel olarak anlamlı doğrudan negatif bir ilişki ve etkisi olduğunu göstermektedir. Sonuçlara dayanarak, çalışma, hayır kurumlarının elektronik pazarlama araçlarını kullanma etkinliğini artırmak için pratik öneriler sunmaktadır. Bu öneriler arasında, kamuoyuyla güven inşa etmeye odaklanmak, sunulan içeriğin kalitesini artırmak ve özellikle ücretli araçlar kullanıldığında finansal kaynaklardan en iyi şekilde yararlanmak için bu alanda deneyimli ve yetkin kişilerin istihdam edilmesi yer almaktadır.
Evli Bireylerde İlişkisel Benlik Değişimi ile Eşe Kendini Açma Algısının İncelenmesi
(İstanbul Sabahattin Zaim Üniversitesi, 2024) Usta, Fatma; Kabaklı Çimen, Latife
Bu çalışmanın amacı, evli bireylerde ilişkisel benlik değişimi ile eşe kendini açma algısının nicel araştırma yöntemlerinden, ilişkisel tarama yöntemi ile incelenmesidir. Araştırmada, "İki Boyutlu İlişkisel Benlik Değişimi Ölçeği" ve "Eşe Kendini Açma Ölçeği" kullanılmıştır. Çalışma grubu 261 evli bireyden oluşmaktadır. Veriler, SPSS (Statistical Package for Social Sciences) Windows 22 programına kaydedilerek analiz edilmiştir. Dağılımın normalliğini değerlendirmek için kolmogorov-smirnov testi, normalliğin diğer varsayımları için basıklık ve çarpıklık değerleri kullanılmıştır. Bağımsız iki grup arasındaki karşılaştırmaları T-Testi (Independent Sample T-Testi), iki ya da ikiden fazla grup arasındaki karşılaştırmalar için tek yönlü varyans analizi kullanılmıştır. Varyanslar, homojenlik varsayımı sağlamadığında Welch istatistiği, çoklu karşılaştırma testi olarak Bonferroni testleri kullanılmıştır. Sayısal değişkenler arasındaki ilişkiyi değerlendirmek için Pearson korelasyon katsayısı, bağımsız değişkenlerin bağımlı değişken üzerine etkisi çoklu regresyon analizi ile değerlendirilmiştir. Yapılan değerlendirmeler sonucunda, evli bireylerin ilişkisel benlik değişimi ve eşe kendini açma düzeyleri farklılıklar göstermektedir. Benlik değişimi ve eşe kendini açma, cinsiyet, gelir düzeyi, evlenme biçimi, eş ile yaş farkına göre istatiksel olarak anlamlı farklılıklar göstermemektedir. Eşe kendini açma ve alt boyutları, ilişkinin niteliği, farkındalık, açıklık yaş değişkenine göre farklılaşmaktadır. Benlik genişlemesi ile benlik budanması, evlilik yaşına göre anlamlı farklılıklar göstermemektedir. Eşe kendini açma, ilişkinin niteliği, farkındalık, açıklık ile benlik genişlemesi ve benlik budanması, eşin kök ailesinden memnuniyet düzeyine göre olumlu yönde anlamlı farklılıklar göstermektedir. Eşe kendini açma ve alt boyutları, ilişkinin niteliği, farkındalık, açıklık değişkenleri ile benlik genişlemesi pozitif, benlik daralması arasında negatif yönde anlamlı ilişkiler bulunmaktadır. Benlik genişlemesi ve benlik daralması, evli bireylerin eşe kendini açma düzeylerini etkilemektedir.