Kan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Türlerinin Eşey Tipi (MTL) Genotiplerinin Belirlenmesi

dc.contributor.authorMetin, Banu
dc.contributor.authorYaşar, Melike
dc.contributor.authorHoşbul, Tuğrul
dc.contributor.authorDöğen, Aylin
dc.contributor.authorHilmioğlu Polat, Süleyha
dc.contributor.authorİlkit, Macit
dc.date.accessioned2023-08-25T08:57:48Z
dc.date.available2023-08-25T08:57:48Z
dc.date.issued2021en_US
dc.departmentMühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesien_US
dc.description.abstractAmaç: Candida parapsilosis, sistemik kandidoz etkenleri arasında Candida albicans’tan sonra en sık rastlanan Candida türlerinden biridir. Candida türlerinde eşey tipinin belirlenmesi ve eşeyli üremenin gerçekleştirilmesi, eşey tipi (MTL) gen bölgesi kontrolünde gerçekleşir. Bu bölge, iki farklı eşey tipinde (a ve α) tamamen farklı dizilimlerde olup idiomorf olarak adlandırılır. MTLa idiomorfu a1 ve a2 transkripsiyon faktörlerini kodlarken, MTLα, α1 ve α2 proteinlerini kodlar. Bu genler haricinde her iki idiomorfta da eşeyli üreme ile ilgili işlevleri bilinmeyen PAB, OBP ve PIK genlerinin a ya da α versiyonları vardır. Candida parapsilosis ve yakın ilişkili Candida orthopsilosis ile Candida metapsilosis türlerinde ise, bugüne kadar eşeyli üreme döngüsüne bugüne kadar rastlanmamıştır. Gerçekleştirilen incelemelerde, C. orthopsilosis’in MTLa ve MTLα homozigot ve MTLa/MTLα heterozigot genotiplerini içeren karışık bir popülasyon yapısına sahip olduğu, C. metapsilosis izolatlarının çoğunluğunun ise MTLa/MTLα heterozigot olduğu belirlenmiştir. Buna karşılık, şimdiye kadar incelenen C. parapsilosis izolatlarının hepsinin tek bir eşey tipinde (MTLa) olduğu görülmüştür. Yöntem: Sunulan çalışmada, Türkiye kaynaklı C. parapsilosis kökenlerinin MTL genotiplerinin belirlenmesi amaçlanmış ve bu amaçla 167 kan izolatı incelendi. ITS bölgesinin PCR’da çoğaltılarak sekanslanması ile C. parapsilosis olarak identifikasye edilen izolatlar, MTLa1, MTLa2, MTLα1 ve MTLα2 genleri yönünden taranmıştır. Bulgular: PCR sonucunda yalnızca MTLa1 ve MTLa2 genlerine rastlanmıştır; dolayısı ile tüm izolatların MTLa genotipine sahip olduğu belirlenmiştir. Sonuç: Bulgular önceki çalışmalarla birlikte değerlendirildiğinde, C. parapsilosis’in MTLα eşey tipinin zaman içerisinde yok olduğu veya henüz araştırılmamış coğrafi bölgelerde varlığını sürdürecek şekilde seyrek olduğu sonucuna varılmıştır.en_US
dc.description.abstractObjective: Candida parapsilosis is one of the most common species after Candida albicans among the causative factors of systemic candidosis. In Candida species, determination of the cell identity and the sexual reproduction process take place under the control of the mating type (MTLα) locus. This region has completely different sequences in two different mating types (a and α) and is called an idiomorph. While the MTLa idiomorph encodes the transcription factors a1 and a2, MTLα encodes α1 and α2 proteins. Apart from these genes, both idiomorphs have a or α versions of PAB, OBP, and PIK genes, whose functions in sexual reproduction are unknown. On the other hand, up to now neither Candida parapsilosis nor the closely related species Candida orthopsilosis or Candida metapsilosis has been reported to have sexual cycles. While C. orthopsilosis was found to have a mixed population structure harboring MTLa and MTLα homozygous and MTLa/MTLα heterozygous genotypes in realized studies, the majority of C. metapsilosis isolates were MTLa/ MTLα heterozygotes. Nevertheless, all C. parapsilosis isolates analyzed were found to be of a single mating type (MTLa). Method: This study was aimed to determine the MTL genotypes of C. parapsilosis isolates of Turkey origin, and 167 blood isolates were used for this purpose. The isolates identified as C. parapsilosis by PCR-amplifying and sequencing the ITS region were screened for MTLa1, MTLa2, MTLα1 and MTLα2 genes. Results: Only MTLa1 and MTLa2 genes were detected in PCR; therefore, all isolates were determined to have the MTLa genotype. Conclusion: When the results are assessed with previous findings, it could be inferred that the MTLα mating type of C. parapsilosis has been lost or extremely rare in yet unanalyzed geographical regions.en_US
dc.identifier.doi10.5222/TMCD.2021.71463
dc.identifier.endpage14en_US
dc.identifier.issn0258-2171
dc.identifier.issn2458-7516
dc.identifier.issue1en_US
dc.identifier.orcidBanu Metin |0000-0002-3203-0058en_US
dc.identifier.orcidMelike Yaşar |0000-0001-8913-2314en_US
dc.identifier.orcidTuğrul Hoşbul |0000-0002-0150-4417en_US
dc.identifier.orcidAylin Döğen |0000-0002-0388-306Xen_US
dc.identifier.orcidSüheyla Hilmioğlu Polat |0000-0001-8850-2715en_US
dc.identifier.orcidMacit İlkit |0000-0002-1174-4182en_US
dc.identifier.startpage11en_US
dc.identifier.trdizinid504763en_US
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.5222/TMCD.2021.71463
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12436/5284
dc.identifier.volume51en_US
dc.indekslendigikaynakTR-Dizin
dc.institutionauthorMetin, Banu
dc.language.isotr
dc.publisherTürk Mikrobiyoloji Cemiyetien_US
dc.relation.ispartofTürk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisien_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectCandida parapsilosisen_US
dc.subjectMTL locusen_US
dc.subjectMTLa idiomorphen_US
dc.titleKan Kültürlerinden İzole Edilen Candida parapsilosis Kompleks Türlerinin Eşey Tipi (MTL) Genotiplerinin Belirlenmesien_US
dc.title.alternativeIdentification of The Mating Type (MTL) Genotypes of Clinical Candida parapsilosis Complex Species isolated from Blood Culturesen_US
dc.typeArticle
dspace.entity.typePublication

Dosyalar

Orijinal paket

Listeleniyor 1 - 1 / 1
Yükleniyor...
Küçük Resim
İsim:
pdf_TMC_703.pdf
Boyut:
277 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Makale dosyası / Article file

Lisans paketi

Listeleniyor 1 - 1 / 1
Yükleniyor...
Küçük Resim
İsim:
license.txt
Boyut:
1.44 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama: