Antioxidative activities of hazelnut protein hydrolyzates as predicted by in silico analysis techniques

dc.contributor.authorGülseren, İbrahim
dc.contributor.authorGülseren, İbrahim
dc.date.accessioned2022-03-04T19:12:42Z
dc.date.available2022-03-04T19:12:42Z
dc.date.issued2019
dc.departmentMühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi
dc.description.abstractRecently, a variety of studies have been carried out on the production and analysis ofbioactive peptides. Here, based on in silico methods, antioxidative behavior of hazelnut(Corylus avellana L.) peptides, which could be prepared by enzymatic treatments with 3gastrointestinal (GI) and 3 non-GI enzymes were evaluated. On 10/03/2017, UniProt databaselisted 469 hazelnut proteins. In the current study, a subset (23 ribosomal proteins) of theseproteins were examined and the activity of the GI proteases (trypsin, pepsin, chymotrypsin)for the production of antioxidative peptides were compared to non-GI proteases (thermolysin,papain and bromelain). Firstly, potential antioxidative peptide sequences were determined. GIproteases were less effective compared to non-GI proteases in the manufacture ofantioxidative peptides. Antioxidative property of peptides, which were obtained bythermolysin or papain treatments, were significantly higher compared to GI proteases. Whenall 23 proteins were treated 37 antioxidative peptides were formed by thermolysin, while 10antioxidative peptides were predicted for trypsin. Of the 138 cases studied (23 proteins x 6proteases), 44 antioxidative peptides were detected (i.e., 1 peptide in approx. 32% of allcases). Based on current findings, hazelnut proteins can be considered a valuable resource forantioxidative peptide manufacture.
dc.description.abstractGünümüzde biyoaktif peptitlerin üretimi ve analizi ile ilgili olarak birçok çalışma yapılmaktadır. Bu çalışmada, in silico yöntemler kullanılarak 3 gastrointestinal (Gİ) ve 3 Gİ olmayan enzim muamelesi ile hazırlanması muhtemel fındık (Corylus avellana L.) peptitlerinin antioksidatif davranışları değerlendirilmiştir. 10 Mart 2017 itibariyle, UniProt veri tabanında 469 fındık proteini listelenmiştir. Bu çalışmada, söz konusu proteinlerin bir alt kümesi (23 ribozomal protein) incelenmiştir ve in silico proteoliz yöntemleri ile antioksidatif peptitlerin üretimi için gastrointestinal (Gİ) proteazların (tripsin, pepsin, kimotripsin) etkinliği; termolisin, papain ve bromelain gibi Gİ olmayan proteazlarla karşılaştırılmıştır. Elde edilen muhtemel antioksidatif peptit dizilimleri ve bunların sayıları her bir proteaz için belirlenmiştir. Birçok durumda, Gİ proteazlarının antioksidatif peptitlerin üretiminde Gİ olmayan proteazlara oranla daha az etkili olduğu gösterilmiştir. Özellikle termolisin veya papain kullanımı ile elde edilmesi olası peptitlerin antioksidatif özelliği Gİ proteazlara baskındır. Örneğin söz konusu 23 proteinden termolisin kullanımı ile 37 antioksidatif peptit oluşurken tripsin ile toplam 10 antioksidatif peptit oluşması beklenmektedir. 23 protein ve 6 proteaz göz önüne alınarak yürütülen 138 analizin 44 tanesinde (incelenen bütün durumların yaklaşık %32’sinde) antioksidatif peptitlerin oluşma olasılığı saptanmıştır. Mevcut bulgulara dayanarak, fındık proteinlerinin antioksidatif peptitlerin üretimi için değerli bir kaynak olarak kabul edilmesi mümkün görünmektedir.
dc.identifier.doi10.29050/harranziraat.470105
dc.identifier.endpage353
dc.identifier.issn2148-5003
dc.identifier.issn2587-1358
dc.identifier.issue3
dc.identifier.orcid0000-0002-7339-1159
dc.identifier.startpage345
dc.identifier.trdizinid389119
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.29050/harranziraat.470105
dc.identifier.urihttps://app.trdizin.gov.tr/makale/TXpnNU1URTVPUT09
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12436/3285
dc.identifier.volume23
dc.indekslendigikaynakTR-Dizin
dc.institutionauthorGülseren, İbrahim
dc.language.isoen
dc.relation.ispartofHarran Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanı
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectPlant protein peptides
dc.subjectCommon hazelnut (Corylus avellana L.)
dc.subjectRibosomal proteins
dc.subjectIn silico proteolysis
dc.subjectBitki proteini peptidleri
dc.subjectFındık (Corylus avellana L.)
dc.subjectRibozomal proteinler
dc.subjectIn silico proteoliz
dc.titleAntioxidative activities of hazelnut protein hydrolyzates as predicted by in silico analysis techniques
dc.title.alternativeFındık protein hidrolizatlarının antioksidatif aktivitelerinin in silico analiz teknikleri ile öngörülmesi
dc.typeArticle
dspace.entity.typePublication
relation.isAuthorOfPublicationb65dbcb5-0c46-4aec-8297-3203aa9f2632
relation.isAuthorOfPublication.latestForDiscoveryb65dbcb5-0c46-4aec-8297-3203aa9f2632

Dosyalar

Orijinal paket

Listeleniyor 1 - 1 / 1
Yükleniyor...
Küçük Resim
İsim:
10.29050-harranziraat.470105-804155.pdf
Boyut:
1020.61 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Makale dosyası / Article file